Программы для ЭВМ

Программа предназначена для автоматизации процесса обновления и настройки системы запуска GRID-задач на локальном вычислительном кластере (Advanced Resource Connector), разработанной для обработки результатов экспериментов, проводимых на Большом Адронном Коллайдере. Используется администраторами Tier-1 в НИЦ «Курчатовский институт» для поддержания инфраструктуры в согласованном состоянии, автоматизации процессов администрирования вычислительного кластера, масштабирования и обновления ARC.Тип ЭВМ: IBM РС-совмест. ПК; ОС: CentOS. Shell

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа служит для управления коллиматорными шторками на станции СТМ Курчатовского источника синхротронного излучения. Движение шторок осуществляется с помощью шаговых двигателей, подключенных к контроллеру ACS Motion SPiiPlus, который связан с управляющим компьютером через локальную сеть. Программа позволяет двигать шторки, отслеживать их положение в реальном времени, сохранять в памяти компьютера текущее положение шторок и перемещать шторки в одно из ранее сохраненных положений. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК, ОС: Windows. Python 3.7

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа «checkauthdata» представляет собой сенсор для системы мониторинга Nagios и предназначена для проверки состояния инфраструктуры открытых ключей, используемых для авторизации в ГРИД. Сенсор проверяет наличие и корректность сертификатов удостоверяющих центров, наличие и корректность списков отозванных сертификатов, соответствие установленных сертификатов политике EGI, а также их актуальность. Также при необходимости может быть проведена проверка наличия и корректности сертификата узла. Наличие на узле такого сенсора позволяет оперативно выявлять и устранять ошибки авторизации. Тип ЭВМ: IBM compatible. ОС: CentOS. Bash

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа создана для работы с порошковыми рентгеновскими дифрактограммами и предназначена для исправления геометрических нелинейностей рентгеновских детекторов путем калибровки угловой шкалы дифракционной картины. Программа сопоставляет экспериментальное положение дифракционных рефлексов выбранного кристаллографического стандарта с базой данных, автоматически подбирает коэффициенты выпрямляющей функции и применяет её ко всем заданным дифрактограммам. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows. Python 3.8

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для расчета динамики разогрева литий-ионного аккумулятора при эксплуатации в условиях экстремально низких температур за счет собственного тепловыделения при разряде на прилегающий тепловыделяющий элемент. Определены динамические характеристики аккумулятора, время и динамика пускового режима, потери емкости на саморазогрев и параметры тепловыделяющего элемента. Результаты расчетов визуализируются в Excel. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows, Linux. Delphi

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для расчета и анализа спектров реакторных антинейтрино с использованием экспериментальных данных по реакторным кумулятивным бета-спектрам. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows, Linux. С++

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа выполняет автоматический поиск и загрузку в систему «Проектная деятельность» метаданных научной публикации путём идентификации по DOI (digital object identifier). DOI задаётся в соответствующем поле системы ответственным по подразделению. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows, Linux, MacOS. Java 1.8

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа обеспечивает исключение дублирования вносимой в систему «Проектная деятельность» информации о научных публикациях путем сравнительного анализа названия публикаций и их идентификации по DOI. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Linux, Windows, MacOS. Java

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа (demuxDDrad) для демультиплексации данных, полученных с помощью ddRAD секвенирования на приборе illumina NovaSeq 6000. Программа производит демультиплекасацию по внутренним индексным последовательностям (находящихся в начале самих нуклеотидных чтений). В качестве "входящих" файлов принимает нуклеотидные чтения, созданные при демультиплексации по внешним индексам с помощью стандартной утилиты от illumina - bcl2fastq, и таблицы с названиями образцов и последовательностями внутренних индексов. Для каждого образца требуется две индексные последовательности. Для определения индексных последовательностей необходима информация о протоколе приготовления ddRAD библиотек. В качестве базового протокола используется протокол, опубликованный в статье Franchini (PMID: 28247584). Этот протокол подразумевает, что перед индексной последовательностью находится последовательность из четырех случайных нуклеотидов, которая удаляется, в процессе работы скрипта, перед демультиплексацией. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Linux. Perl 5.0 и новее

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа позволяет пользователю сравнивать файлы аннотации соматических мутаций, полученных с помощью различных аннотаторов. На вход подается файл с аннотацией, как правило полученного от исследуемого пациента, а также может использоваться файл с аннотацией в качестве контроля. Фильтрация данных возможна как по списку генов, например связанных с онкологическими заболеваниями, так и по одиночному гену. Также возможна фильтрация мутаций по их типу, может применяться к естественным несинонимичным полиморфизмам и лабораторно-индуцированным миссенс-мутациям. На выходе остается файл с аннотаций соматических мутаций, которые представляют наибольшую клиническую значимость. Данная программа может быть полезна исследователям и врачам для анализа соматических мутаций. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Linux. Perl 5.0 и выше

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)