Программы для ЭВМ

Программное обеспечение предназначено для получения характеристик нуклеотидных геномных последовательностей. Программа получает входные файлы в формате FASTA — наиболее распространённом для геномных данных, поддерживаются форматы сжатия данных gzip и bzip2. Выходные данные содержат имя файла, суммарное процентное содержание гуанидина и цитозина в последовательностях, количество последовательностей, метрики N50, L50, N90, L90, количество неустановленных нуклеотидов. Выходные данные могут быть представлены в одном из трёх форматов на выбор: человеко-читаемый, табличный, JSON. Выходные данные могут быть записаны в базу данных формата SQLite для удобного хранения и управления собранными данными. Тип ЭВМ: Персональный компьютер IBM PC; ОС: Linux, macOS. Python 3.6 и выше

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для анализа биогеографической информации содержащейся в базах данных генетической информации, позволит провести анализ всего Цианобактериального разнообразия Антарктиды. Данная программа может быть использована для анализа географического распределения не только генов 16S рРНК, но и других генов, в том числе функциональных. тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК. ОС: Linux. Python 3.6 и новее

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для обработки исходных данных, сборки, проверки качества и аннотации геномов бактерий и архей. В качестве исходных данных могут быть использованы одиночные или парные прочтения высокопроизводительного секвенирования, прочтения одномолекулярного секвенирования или их комбинация. Алгоритм включает обрезку прочтений по качеству, слияние перекрывающихся парных прочтений, сборку генома, поиск и удаление последовательности внутреннего контроля секвенирования по технологии Illumina - phiXl 74, оценку качества сборки по наличию маркерных однокопийных генов, структурную и функциональную аннотацию и генерацию файлов в общепринятых биоинформатических форматах. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Linux, macOS. Python 3.6 и новее

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программное обеспечение предназначено для определения расстояний между геномными последовательностями на основании полногеномного нуклеотидного выравнивания, приближённых методов оценки идентичности геномных последовательностей и выравнивания аминокислотных последовательностей предсказанных белок-кодирующих генов. На основании установленных расстояний проводится иерархическая кластеризация последовательностей и создаётся визуализация в виде дендрограммы и тепловой карты. Визуализации сохраняются в векторном и растровом формате. Кроме того, на основании геномных расстояний строится филогенетическое дерево методами UPGMA и NJ. Выделение кластеров геномных последовательностей проводится по указанному пользователем порогу. Программа имеет широкие перспективы в анализе геномов прокариот и эукариотических микроорганизмов. Тип ЭВМ: Персональный компьютер IBM PC. ОС: Linux, macOS. Python 3.6 и новее

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для библиотеки Python «Cherab», которая с помощью метода трассировки лучей рассчитывает спектральные интенсивности излучения плазмы в диапазоне от ближнего ультрафиолета до ближнего инфракрасного излучения, регистрируемые различными оптическими диагностиками. Программа позволяет использовать Cherab для оптических диагностик токамака Т-15МД. Программа содержит функции для загрузки детальной модели вакуумной камеры и первой стенки токамака Т-15МД. Программа поддерживает описание диагностических систем и характеристик материалов первой стенки в формате JSON. В программе есть функции для чтения результатов расчётов кода SOLPS 4.3, что позволяет создавать в Cherab модель плазмы на основе этих результатов. Программа аналогична существующим модулям Cherab для токамаков JET, MAST-U, ASDEX-U, Compass и TCV. Python 3.6+

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа вычисляет величины изменения синаптических весов нейрона под действием Spike-Timing-Dependent Plasticity (STDP)-подобной пластичности, вид которой соответствует аппроксимации экспериментальных измерений проводимостей мемристоров: изменение проводимости зависит от текущего её значения и от разности моментов пре- и пост-спайков; и данная зависимость имеет вид экспоненты, сдвинутой на константу. Константы данной зависимости различаются между синапсами одного нейрона на заданную случайную величину для имитации неоднородности характеристик мемристоров. Нейрон моделируется пороговым элементом, сравнивающим свой входящий ток с заданным значением; входящие токовые импульсы имеют зигзагообразную форму, часто используемую в экспериментах над мемристорами. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: удовлетворяющая стандарту POSIX. Python 3.6, bash

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа для ЭВМ предназначена для расчета процессов окисления оболочки твэла и определения толщин пленки оксида циркония и диоксида циркония. Использование программы позволяет находить константы для дифференциальных уравнений и осуществлять их решение, а также осуществлять интерполяцию входных массивов данных по температуре, разбиению и количеству твэлов. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК. ОС: Windows. Python 3.7

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программный комплекс предназначен для хранения и извлечения данных и организации потока вычислений процесса окисления оболочки твэла. Разработанный программный комплекс позволяет считывать и обрабатывать входной файл с заданными пространственными распределениями температур оболочек твэлов, временем расчета и количеством элементов; подключать библиотеку функций, необходимую для расчета процессов окисления оболочки твэлов; подгружать константы для решения дифференциальных уравнений и теплофизические свойства веществ; позволяет рассчитывать временную зависимость толщин пленок оксида циркония и диоксида циркония, а также формировать понятный для восприятия выходной файл с результатами расчета.Тип ЭВМ: IBM PC - совмест. ПК; ОС: Windows. Python 3.7

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для определения распределения связанной воды в объеме иономера в каталитических слоях и мембране низкотемпературного ТЭ с ТПЭ в условиях переменной влажности рабочих газов. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows; Linux. Python 3.7

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Программа предназначена для поиска программных модулей в базе данных диалоговым методом. Может применяться в крупных базах данных с близкими по характеристикам объектами. Функционал программы позволяет выдавать всегда один или ноль найденных объектов. Программа предоставляет таблицу с названиями программ и списком ключевых слов для каждой из них. Пользователю необходимо последовательно выбирать из выпадающих списков ключевые слова и в интерактивном режиме будет сообщаться количество программ с данными ключевыми словами. Как только будет найдена одна и только одна программа, пользователь получает доступ к коду. При последовательном выборе ключевых слов уменьшается количество программ, содержащих в своем описании указанные пользователем ключевые слова. При отсутствии программы с выбранными ключевыми словами в базе данных пользователю будет это сообщено. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: macOS. Python 3.7

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Институт теоретической и экспериментальной физики имени А.И. Алиханова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» (RU)