+7 499 196 95 39
Программное обеспечение предназначено для определения расстояний между геномными последовательностями на основании полногеномного нуклеотидного выравнивания, приближённых методов оценки идентичности геномных последовательностей и выравнивания аминокислотных последовательностей предсказанных белок-кодирующих генов. На основании установленных расстояний проводится иерархическая кластеризация последовательностей и создаётся визуализация в виде дендрограммы и тепловой карты. Визуализации сохраняются в векторном и растровом формате. Кроме того, на основании геномных расстояний строится филогенетическое дерево методами UPGMA и NJ. Выделение кластеров геномных последовательностей проводится по указанному пользователем порогу. Программа имеет широкие перспективы в анализе геномов прокариот и эукариотических микроорганизмов. Тип ЭВМ: Персональный компьютер IBM PC. ОС: Linux, macOS. Python 3.6 и новее