Базы данных

База данных содержит информацию о биогеографическом распределении 2865 нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК цианобактерий из наземных, озерных, криофильных и морских микробных сообществ Антарктиды. Для каждой последовательности представлен идентификатор в базе данных NCBI. Также база данных содержит информацию о типе местообитания, из которого получена нуклеотидная последовательность, географическом регионе происхождения нуклеотидной последовательности и координатах места отбора. При наличии научных публикаций в базе данных представлены ссылки на научные публикации с развернутой информацией об исследованиях, проводимых с использованием этих данных. База данных представляет интерес для биоинформатиков, молекулярных биологов и специалистов в области биогеографии микроорганизмов для поиска штаммов продуцентов для биотехнологии и изучения закономерностей биогеографического распределения микроорганизмов. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит результаты автоматической сегментации анатомических структур головного мозга человека, с указанием названий и объёмов мозговых структур, полученные вследствие обработки и математического анализа экспериментальных данных ядерной магнитно-резонансной томографии (МРТ) головного мозга человека. Данная информация используется для построения 3D-модели головного мозга и нейровизуализации с целью научно-исследовательского анализа или в медицинских целях (ранняя диагностика патологии, отслеживание динамики изменений мозговых структур и другое). Тип ЭВМ: Рабочая станция Apple Mac Mini на базе архитектуры х86; ОС: Linux, Windows, MacOS. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит метагеномную информацию различных биотопов республики Карелия. Используя ГИС технологии, данные космических снимков Карелии были проанализированы с помощью специальных алгоритмов, позволяющих кластеризовать пиксели изображения, согласно их спектральным характеристикам и тем самым были определены места сбора материала. В данной базе данных приведены спектры микроорганизмов для 160 образцов из 43 точек с различными биотопами. Биоинформатический анализ сообществ на основе выбора операционных таксономических единиц (OTE) проводился с использованием алгоритма USEARCH. Соотнесение OTE с таксонами прокариот проводилось путем выравнивания против базы данных Silva 128. База данных представляет интерес для биоинформатиков, молекулярных биологов и специалистам по спутниковому мониторингу для оптимизации экологических исследований и работ по мониторингу. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Среди кавернозных мальформаций (каверном, КМ) ЦНС около 10-30% относятся к наследственной форме патологии с аутосомно-доминантным типом наследования. Генные мутации, обуславливающие развитие заболевания, активно изучаются. Создаются тест-системы для диагностики патологии, в экспериментальных условиях апробируются препараты, блокирующие патологические каскады ангиогенеза. Данная база данных содержит деперсонализированную информацию о генетических исследований у 73 больных: 29 - с наследственной формой заболевания, 6 - с условно доказанными семейными каверномами и 38 - со спорадическими каверномами. Во всех случаях выполнен поиск крупных мутаций методом мультиплексной амплификации лигазно-связанных проб (MLPA), в том числе во всех трех генах ССМ. В тех случаях, когда крупные изменения генов у больных с клинически доказанными наследственными формами не были обнаружены, выполнено полноэкзомное секвенирование для выявления и анализа точечных мутаций и полиморфизмов (SNP). Дальнейшее изучение типов мутаций в генах ССМ, сопровождаемое клиническими исследованиями, позволит создавать более простые и дешевые диагностические тест-системы с целью прогнозирования развития церебральных каверном у конкретных людей. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о природных ресурсах и других показателях, описывающих различные энерготехнологии. На их основе рассчитаны весовые коэффициенты следующих критериев: надежность, ресурсообеспеченность, доступность, диверсификация. Использование этих критериев в методах многокритериального анализа для сравнения типов станций позволит получить результаты менее чувствительные к экономическим условиям и более соответствующие принципам устойчивого развития. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) содержит информацию о полных геномах типовых штаммов Актинобактерий. В базе данных представлены 91378 значений средней аминокислотной идентичности (САИ) наборов кодирующих последовательностей, стандартного отклонения САИ и доле от набора генов, определённых на основании алгоритма выравнивания diamond. В базе данных представлены 19030 значений средней нуклеотидной идентичности (СНИ) геномных последовательностей и доли длины выравнивания, рассчитанные алгоритмом fastANI. Для каждого генома указан идентификатор в базе данных NCBI RefSeq, таксономический идентификатор в базе NCBI Taxonomy, таксономическое наименование и статус репрезентативного генома (1 - да, 0 - нет) на основании СНИ. БД представляет интерес для биоинформатиков, молекулярных биологов и специалистов в области биотехнологий для верификации таксономии и оптимизации биотехнологических работ, включая конструирование новых штаммов. БД создана в рамках соглашения с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации от 31.10.2020 № 075-5-2019-1659. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о фототрофных микроорганизмах, выделенных из озера Котокель. Представлено описание цианобактерий (в том числе гетероцистных), выделенных в период наблюдения за цветениями озера в 2016-2017 годах. Представлена информация о выделении микроорганизмов, их культурально-морфологических особенностях, активности, оптимальных условиях хранения и культивирования, а также микрофотографии всех культур. База данных представляет интерес для микробиологов, молекулярных биологов, экологов и биотехнологов. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о фототрофных микроорганизмах, выделенных из озера Байкал. Представлено описание цианобактерий и микроводорослей, выделенных в период наблюдения за цветениями озера в 2016-2017 годах. Представлена информация о выделении микроорганизмов, их культурально-морфологических особенностях, активности, оптимальных условиях хранения и культивирования, а также микрофотографии всех культур. База данных представляет интерес для микробиологов, молекулярных биологов, экологов и биотехнологов. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит последовательности геномов вирусов оспы сливы, которые были обнаружены на других плодовых. Полученные данные являются источником новых знаний о данном вирусе, что необходимо для поиска эффективных методов борьбы с его распространением. Созданная база будет полезна и интересна для специалистов в области вирусологии и сельского хозяйства. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит результаты сравнительного анализа наборов выходных параметров объёмов основных анатомических структур головного мозга человека, полученных вследствие обработки данных МРТ экспериментов, выполненных для каждого испытуемого группы последовательно, в двух различных режимах MP томографа (режим 1 – Anatomy, режим 2 – FS). Данная информация используется для определения величины и направленности погрешности в определении размеров анатомических структур 3D-модели головного мозга человека, получаемой вследствие смены режима MP томографа. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)