Изобретение относится к микробиологии и представляет собой штамм дрожжей Yarrowia lipolytica 583 ВКПМ Y-4657 с инактивированным геном YlYHM2 и усиленной экспрессией генов YlAMPD и YlSFC1, продуцирующий изолимонную кислоту в условиях избытка источника углерода и лимита источника азота. Изобретение позволяет получать изолимонную кислоту с высокой степенью эффективности. Штамм дрожжей Yarrowia lipolytica 583 ВКПМ Y-4657 с инактивированным геном ?l???2 и усиленной экспрессией генов YlAMPD и YlSFC1, продуцирующий изолимонную кислоту в условиях избытка источника углерода и лимита источника азота.