+7 499 196 95 39
Программа предназначена для анализа представленности микроорганизмов в биотопе по данным высокопроизводительного секвенирования shotgun и ампликонов 16S рРНК, ITS (внутреннего транскрибируемого спейсера). В качестве исходных данных могут быть использованы таксономически классифицированные таблицы с количественными значениями амплифицированных последовательностей (ASV). Алгоритм анализа включает объединение ASV на уровне рода, расчет представленности с относительной, логарифмической и центроидной логарифмической нормализацией для разного процента корового микробиома, а также визуализацию полученных данных.