+7 499 196 95 39
Программа предназначена для реконструкции геномов на основании метагеномных данных — метагеномного биннинга. В качестве входных файлов программа использует данные секвенирования и метагеномную сборку. Программа фрагментирует метагеном, определяет глубину покрытия и распределение частот к-меров (фрагментов ДНК произвольной длины), затем проводит нормализацию данных, уменьшение размерности данных, кластеризацию. Готовые метагеномные бины доступны пользователю в формате FASTA, промежуточные данные экспортируются в в виде текстовых таблиц, что позволяет продолжить работу с данными с любого этапа. Визуализация результата кластеризации данных доступна пользователю в растровом и векторном форматах. Программа позволяет использовать преимущества многопоточности на всех этапах работы. ОС: Linux, macOS. Python