Базы данных

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа частот использования кодонов в геномах типовых штаммов грибов. Ввиду избыточности генетического кода одна аминокислота может быть кодирована более чем одним триплетом нуклеотидов (кодонов). При этом синонимичные замены не влияют на структуру и функции белка, а замена минорных (редких) кодонов на синонимичные мажорные (частые) приводит к увеличению скорости синтеза пептидов. Таким образом, знание частот использования кодонов может помочь в выборе оптимальных кодонов для повышения эффективности трансляции гена для целей биотехнологии. Для 1 043 публично доступных геномов типовых штаммов грибов были предсказаны открытые рамки считывания и определены относительные частоты для каждого из 64 кодонов. Каждая запись сопровождается бинарной таксономией и таксономическим идентификатором NCBI для упрощения дальнейшей работы с базой. БД может представлять интерес для биоинженеров, молекулярных биологов, биотехнологов и биоинформатиков. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о РНК-олигонуклеотидах, являющихся направляющими РНК для тестирования возможности Cas эффекторов катализировать высокоспецифичное и эффективное расщепление ДНК-мишени in vitro. Направляющие РНК- олигонуклеотиды состоят из фиксированной последовательности скаффолда, характерной для исследуемого эффектора, и переменных З'-спейсерных частей. База данных предназначена для специалистов в области молекулярной биологии и биоинженерии, и может использоваться для исследований CRISPR/Cas систем. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для сбора, хранения и анализа информации о генах полимераз и белков, связывающих одноцепочечную ДНК. Последовательности генов были найдены при анализе метагеномов 4 образцов микробных сообществ кишечника млекопитающих. База данных включает биоинформатические данные о струкрутуре гена и аминокислотные последовательности 54 ДНК-полимераз типа Б и 15 белков, связывающих одноцепочечную ДНК. База данных содержит информацию о ближайших генах-гомологах, имеющих подтверждённую функциональную аннотацию и/или подлежащих правовой охране. База данных может представлять интерес для специалистов с области биоинженерии, молекулярной и эволюционной биологии. FASTA, электронная таблица в открытом формате документов для офисных приложений (ODF Spreadsheet). Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит результаты расчетов тормозных потерь, связанных с возбуждением электронной и ионной подсистем бериллиевой мишени, проективных пробегов, страгглинга и поперечного рассеяния протонов в зависимости от их энергии в диапазоне значений 0.1 кэВ-100 МэВ. Данные предназначены для анализа радиационных эффектов в бериллии, прогнозирования деградации его эксплуатационных свойств под облучением, выбора параметров ионно-лучевой обработки, планирования имитационных экспериментов, обучения студентов и т.п. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит результаты расчетов тормозных потерь, связанных с возбуждением электронной и ионной подсистем бериллиевой мишени, проективных пробегов, страгглинга и поперечного рассеяния ?-частиц в зависимости от их энергии в диапазоне значений 0.1 кэВ-100 МэВ. Данные предназначены для изучения радиационных эффектов в бериллии, планирования имитационных экспериментов, обучения студентов, проведения фундаментальных и прикладных исследований в области радиационного материаловедения. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит результаты расчетов тормозных потерь, связанных с возбуждением электронной и ионной подсистем бериллиевой мишени, проективных пробегов, страгглинга и поперечного рассеяния при облучении бериллия собственными ионами в диапазоне энергий 0,1 кэВ - 100 МэВ. Данные предназначены для изучения радиационных эффектов в бериллии, планирования имитационных экспериментов, обучения студентов-материаловедов, проведения фундаментальных исследований. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

В базе данных описаны виды стресса у молочнокислых бактерий, физиологические проявления и молекулярно-генетические механизмы устойчивости молочнокислых бактерий к различным видам стресса. База предназначена для ученых, преподавателей, аспирантов и студентов, занимающихся преподаванием и ведущих научные исследования в области генетики, микробиологии и биотехнологии молочнокислых бактерий, а также сотрудников научно- исследовательских отделов предприятий пищевой, кормовой, биотехнологической, фармакологической отраслей промышленности, связанных с разработкой продуктов на основе молочнокислых бактерий. Язык БД: Visual Basic. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) содержит актуализированную на июнь 2023 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях) зарубежных исследователей, в которых описаны подходы к конструированию штаммов-продуцентов рекомбинантной альфа-амилазы, в частности, клонирование и экспрессия гетерологичных генов, кодирующих альфа-амилазу, с использованием различных штаммов-реципиентов. Также представлена характеристика новых альфа-амилаз с промышленно важными свойствами. БД создана для использования при оценке мирового уровня достижений в области получения рекомбинантной альфа-амилазы методом генетической инженерии и при необходимости получения фермента с заданными свойствами. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для сбора, хранения и анализа информации об обнаруженных в геномах коллекционных штаммов актинобактерий (актиномицет) биосинтетеических кластерах и их компонентах. База данных получена анализом геномов 23 бактерий, принадлежащих к следующим родам актинобактерий: Rhodococcus, Kocuria, Bifidobacterium, Dietzia, Arthrobacter и Cellulomonas. База данных включает 8175 аннотированных белок-кодирующих последовательностей, расположенных в 477 локусах. Для каждого предсказанного кластера приведены аминокислотные последовательности белок-кодирующих генов, структурные и функциональные аннотации и нуклеотидные последовательности кластеров. База данных может представлять интерес для специалистов с области молекулярной и эволюционной биологии, промышленных биотехнологий и биомедицины. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для сбора, хранения и анализа информации о прокариотических системах CRISPR/Cas, встречающихся в природных микробных сообществах. База данных получена анализом полнометагеномного секвенирования 30 образцов природных микробных сообществ Республики Северная Осетия - Алания. База данных включает 497 CRISPR/Cas-оперонов. Для каждого оперона приведены его основные характеристики и нуклеотидные последовательности прямого повтора. Также для каждого CRISPR/Cas-оперона представлены последовательности спейсеров, суммарно 2 467 последовательностей. База данных может представлять интерес для специалистов с области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)