Базы данных

База данных (БД) содержит актуальную на июнь 2024 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях и патентах) зарубежных и российских исследователей, в которых описаны дрожжевые Штаммы микроорганизмов-продуценты L- и D-молочной кислоты, источники генов гетерологичных лактатдегидрогеназ, экспрессируемых в клетках дрожжей, подходы метаболической инженерии для создания продуцентов, способы культивирования штаммов-продуцентов. БД создана для использования при конструировании продуцентов молочной кислоты мирового уровня на основе дрожжей, а также для выбора необходимых генетических элементов и модификаций для редактирования дрожжевого генома. Из источников, в которых описаны работы по созданию штаммов-продуцентов молочной кислоты, были выбраны источники, содержащие информацию только по дрожжевым продуцентам молочной кислоты. БД могут использовать в своей работе специалисты в области генетической инженерии дрожжей, биотехнологи и микробиологи.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о названии белка, аминокислотной последовательности, а также молекулярной массе пептидов, полученных в результате гидролиза трипсином, в диапазоне от 50 до 2000 Да. БД получена путем анализа аминокислотных последовательностей 61 выделяемого белка и теоретического расчета молекулярных масс пептидов, образующихся в результате гидролиза этих белков трипсином. БД создана для идентификации и подтверждения аминокислотной последовательности белков, отсутствующих в открытых базах данных UniProt и Swiss-Prot, методом пептидной дактилоскопии. БД представляет интерес для биохимиков и специалистов в области белковой хроматографии, может быть использована для подтверждения аминокислотной последовательности (подлинности) целевого белка, в том числе на стадии продукции, а также оценки качества белкового препарата.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о последовательностях направляющих РНК системы редактирования генома CRISPR-Cas V типа, с помощью которых можно вносить направленные делеций в геном клеточной линии НЕК293Т в трех генах: DNMT1, ЕМХ1 и VEGFA. БД получена путем анализа целевых участков генома клеточной линии НЕК293Т и поиска направляющих РНК с наименьшим офф-таргет эффектом с использованием разработанного биоинформатического пайплайна. База данных включает 44 последовательности направляющих РНК системы CRISPR-Cas V типа. Направляющие РНК нацелены на ДНК- мишени с различными последовательностями РАМ, что позволяет адаптировать их под использование в комплексе с эффекторными белками с различной РАМ-специфичностью. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и клеточной биологии, а также биоинженерии. FASTA, текстовая таблица.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации об аминокислотных последовательностях эффекторных нуклеаз систем CRISPR/Cas II и V типов, встречающихся в микробных сообществах микробиоты лошади. БД получена анализом результатов полнометагеномного секвенирования 12 образцов микробиоты лошади (Бурятия). БД включает 16 аминокислотных последовательностей Cas- эффекторных нуклеаз. Также для каждой аминокислотной последовательности представлен предполагаемый тип CRISPR-Cas системы: II или V, и их подтип. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о нуклеотидных последовательностях спейсеров, которые могут использоваться для создания направляющих РНК для Cas-эффекторов системы CRISPR-Cas VI типа, направленных против РНК карантинных фитопатогенных вирусов. БД получена анализом результатов всех представленных в базе данных NCBI virus последовательностях (дата обращения 03.07.2024) следующих вирусов растений: бенивирус некротического пожелтения жилок свеклы (Beet necrotic yellow vein virus), вирус некротической пятнистости бальзамина (Impatiens necrotic spot virus), вирус пятнистого увядания томата (Tomato spotted wilt virus), неповирус кольцевой пятнистости табака (Tobacco ringspot virus), вироид веретеновидности клубней картофеля (Potato spindle tuber viroid). БД включает ранжированный список спейсеров, нацеленных на высоко консервативные участки РНК фитопатогенов вирусной природы, созданный с использованием веб-ресурса https://casl3design.nygenome.org/. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной биологии, биотехнологии, а также биоинженерии и использоваться для создания диагностических систем обнаружения карантинных фитопатогенов, основанных на системе CRISPR-Cas.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных предназначена для валидации программ для ЭВМ, применяемых для обоснования безопасной эксплуатации реакторов РБМК, в том числе для анализа тяжелых стадий запроектных аварий. База данных состоит из данных по моделированию на критстенде РБМК тяжелой стадии запроектных аварий, а также данных, полученных из экспериментов на критсборках по измерению реактивности систем, пространственного распределения потока нейтронов, взвешиванию отдельных элементов сборок, определению эффектов обезвоживания.

Акционерное общество «Российский концерн по производству электрической и тепловой энергии на атомных станциях» (RU) Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «КУРЧАТОВСКИЙ ИНСТИТУТ» (RU)

База данных содержит таблицы с заселенностями и энергиями молекулярных орбиталей кластеров AnO8 (An = Th - Lr) в диапазоне энергий МО от ~ -10 до ~50 эВ, рассчитанные релятивистским методом дискретного варьирования (РДВ), а также сечения фотоэффекта An 6s-, 6p1/2-, 6р3/2-, 6b3/2-, 6d5/2-, 7S-, 5f5/2-, 5f7/2-, 7р1/2-, 7р3/2- и O 2s-, 2p1/2-, 2р3/2-электронов. Эти таблицы необходимы для расшифровки рентгеновских спектров (фотоэлектронных, конверсионных, эмиссионных, поглощения, резонансной эмиссии валентных электронов и др.) База данных представляет интерес для специалистов в области рентгеноэлектронной спектроскопии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию об олигонуклеотидных полиморфизмах (SNP), характеризующих разные сорта маслины . На сегодняшний день это единственная генетическая база в России по сортам маслины европейской . Информация из базы данных расширяет научные знания о генетике и филогении маслины европейской . Созданная база будет полезна и интересна для специалистов, изучающих данную плодовую культуру.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит параметры легких ядер для А = 1-10: атомное число, число протонов и нейтронов, массу ядра, дефект массы. В базу данных включены параметры возбужденных состояний ядер. Для каждого возбужденного состояния приведены значения: энергии возбуждения и ошибка, значения спин-четности, изоспина, ширины и ошибка ширины. Так же в базу данных включены возможные частичные распады ядер и их параметры, такие как состав распада и его пороговая энергия. Общее число элементов базы данных превышает 10000.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит актуализированную на октябрь 2022 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях) зарубежных и российских исследователей, в которых описаны методы генетической инженерии, вектора (плазмиды), используемые для доставки и экспрессии генов, генетические части, используемые для настройки экспрессии генов, гены-репортёры, используемые для разработки генетических инструментов, гены маркеров для селекции и контрселекции, и полногеномные секвенирования для промышленно-значимых бактерий Rhodococcus. Ценность базы данных заключатся в том, что из большого количества источников, в которых описаны работы с бактериями Rhodococcus, с использованием накопленного авторами опыта вручную (т.к. такая работа не может быть автоматизирована) выбраны источники, содержащие именно генно-инженерные работы. База данных предназначена для использования при оценке мирового уровня достижений в области генетической инженерии бактерий Rhodococcus, а также при выборе методов конструирования и необходимых генетических элементов для штаммов бактерий Rhodococcus. БД создана в рамках соглашения с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации от 31.10.2020 № 075-15-2019-1659. Microsoft Access

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)