Базы данных

База данных содержит индивидуальные структурные коннектомы, рассчитанные для больных шизофренией и группы контроля. Структурные коннектомы построены по данным диффузионной МРТ с использованием разных методов вычисления силы взаимодействия между регионами головного мозга, включая методы, основанные на анализе диффузионного тензора и теории графов. PostgreSQL

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит систематизированные сведения о научных публикациях, представляющих результаты прикладных междисциплинарных исследований в области нано-, био-, инфо- и когнитивных технологий, выполняемых сотрудниками КК НБИКС-ПТ НИЦ «Курчатовский Институт». MySQL 5.7

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию об олигонуклеотидных полиморфизмах (SNP), характеризующих разные сорта данной плодовой культуры. На сегодняшний день это единственная генетическая база в России по сортам персика обыкновенного, уникальная коллекция которого собрана в Никитском ботаническом саду. Информация из базы данных расширяет научные знания о генетике и филогении персика. База данных будет полезна и интересна для специалистов изучающих данную плодовую культуру. MongoDB 4.4.3

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

Диффузная В-крупноклеточная лимфома центральной нервной системы (ДВККЛ ЦНС) – одна из экстранодальных форм агрессивных неходжкинских лимфом, изолированно поражающих головной и спинной мозг и проявляющихся быстропрогрессирующей неврологической симптоматикой. База данных содержит деперсонализированную информацию о генетических исследованиях у 7 больных с диагнозом ДВККЛ ЦНС. Во всех случаях выполнено полноэкзомное секвенирование для выявления и анализа точечных мутаций и полиморфизмов (SNP). MongoDB 4.4.3

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о прокариотических системах CRISPR/Cas, встречающихся в микробных сообществах микробиоты млекопитающих животных. БД получена анализом результатов глубокого полнометагеномного секвенирования 4 образцов микробных сообществ кишечника млекопитающих. База данных включает 137 CRISPR/Cas оперонов. Для каждого оперона приведены его основные характеристики и нуклеотидные последовательности прямого повтора. Также для каждого CRISPR/Cas оперона представлены последовательности спейсеров, суммарно 1 740 последовательностей. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии. Microsoft Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) содержит актуализированную на июль 2023 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях) зарубежных и российских исследователей, посвященных продукции у С. glutamicum аминокислоты L валин и родственных соединений. В представленных источниках приводятся: биохимические реакции пути биосинтеза L валина; ферменты, их катализирующие, и гены этих ферментов; транспортные системы, участвующие в переносе L валина наружу и внутрь клетки, механизмы регуляции биосинтеза и транспорта L- валина; подходы к увеличению продукции данной аминокислоты. Ценность БД заключатся в том, что из большого массива источников, в которых описаны метаболические процессы С. glutamicum и участвующие в них гены, ферменты и регуляторные факторы, автор с использованием накопленного опыта вручную (поскольку такая работа не может быть автоматизирована) выбрал работы, содержащие данные по продукции L-валина и его предшественников. БД предназначена для использования специалистами в области создания на основе С. glutamicum продуцентов L-валина и родственных соединений, а также учёными, занимающимися изучением генетики, биохимии и физиологии коринебактерий. Microsoft Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) содержит актуализированную на июль 2023 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях) зарубежных и российских исследователей, посвященных продукции у С. glutamicum аминокислоты L изолейцин и родственных соединений. В представленных источниках приводятся: биохимические реакции пути биосинтеза L-изолейцина; ферменты, их катализирующие, и гены этих ферментов; транспортные системы, участвующие в переносе L-изолейцина наружу и внутрь клетки, механизмы регуляции биосинтеза и транспорта L-изолейцина; подходы к увеличению продукции данной аминокислоты. Ценность БД заключатся в том, что из большого массива источников, в которых описаны метаболические процессы С. glutamicum и участвующие в них гены, ферменты и регуляторные факторы, автор с использованием накопленного опыта вручную (поскольку такая работа не может быть автоматизирована) выбрал работы, содержащие данные по продукции L-изолейцина, его предшественников и тех метаболитов, для которых предшественником служит сам L-изолейцин. БД предназначена для использования специалистами в области создания на основе С. glutamicum продуцентов L-валина и родственных соединений, а также учёными, занимающиеся изучением генетики, биохимии и физиологии коринебактерий. Microsoft Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о научных статьях исследователей, в которых описана генетическая инженерия бактерий Corynebacterium glutamicum с использованием систем CRISPR/Cas на март 2023 года. База данных предназначена для использования при оценке мирового уровня достижений в области генетической инженерии бактерий Corynebacterium glutamicum, а также при выборе методов конструирования и необходимых генетических элементов для использования систем CRISPR/Cas для штаммов бактерий Corynebacterium glutamicum. БД создана в рамках соглашения с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации от 31.10.2019 № 075-15-2019-1659. Microsoft Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит актуализированную на октябрь 2022 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях) зарубежных и российских исследователей, в которых описаны методы генетической инженерии, вектора (плазмиды), используемые для доставки и экспрессии генов, генетические части, используемые для настройки экспрессии генов, гены-репортёры, используемые для разработки генетических инструментов, гены маркеров для селекции и контрселекции, и полногеномные секвенирования для промышленно-значимых бактерий Rhodococcus. Ценность базы данных заключатся в том, что из большого количества источников, в которых описаны работы с бактериями Rhodococcus, с использованием накопленного авторами опыта вручную (т.к. такая работа не может быть автоматизирована) выбраны источники, содержащие именно генно-инженерные работы. База данных предназначена для использования при оценке мирового уровня достижений в области генетической инженерии бактерий Rhodococcus, а также при выборе методов конструирования и необходимых генетических элементов для штаммов бактерий Rhodococcus. БД создана в рамках соглашения с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации от 31.10.2020 № 075-15-2019-1659. Microsoft Access

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для учета и хранения данных о нуклеотидных последовательностях, предназначенных для использования в качестве праймеров, поступающих в центр геномных исследований мирового уровня «Курчатовский геномный центр». База данных содержит сведения о названии, источнике получения праймера (компания, номер заказа, дата), а также нуклеотидную последовательность праймера. В базу данных внесены также данные о способе очистки, масштабе синтеза и длине праймеров. База данных включает форму ввода и одну основную таблицу. Результаты обработки этих данных могут быть использованы для молекулярно-генетических манипуляций над целевыми нуклеотидными последовательностями (секвенирования нуклеотидных последовательностей, а также для различных скринингов и амплификации). Microsoft Access

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)