Базы данных

База данных содержит данные секвенирования транскриптома лимфоцитов периферической крови пациентов с COVID-19, инфицированнных дельта штаммом коронавируса, поступивших в реанимационное отделение и отличающихся по исходу заболевания, и результаты первичной обработки этих данных биоинформатическими методами. База данных предназначена для исследований в области молекулярной генетики патологических процессов, связанных с развитием у человека инфекционных заболеваний - в том числе вызванных ранее не описанными инфекционными агентами. Тип ЭВМ: IBM-PC совмест. ПК, ОС: Linux. Вид и версия системы управления базой данных: SQLite 3.40.0 Объем базы данных: 6,51 ГБ

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит данные секвенирования транскриптома черной субстанции мозга мышей с токсической моделью поздней доклинической фазы болезни Паркинсона, вызванной внутрибрюшинным введением токсина МФТП, и контрольной группы мышей с введением физиологического раствора. Полученные данные относятся к острой фазе нейродегенерации (временная точка 1 неделя после введения токсина или физиологического раствора мышам линии С57В1). Проведена первичная обработка данных биоинформатическими методами. База данных предназначена для изучения молекулярных механизмов процессов нейродегенерации дофаминергических нейронов в области черной субстанции при формировании клинического фенотипа паркинсонизма. Тип ЭВМ: IBM PC - совмест. ПК; ОС: Вид и версия системы управления базой данных: SQLite 3.40.0 Объем базы данных: 26,11 ГБ

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию о нуклеотидной и аминокислотной последовательности, интенсивности красной флуоресценции, молекулярной яркости и химической стабильности и некоторых других свойствах красного флуоресцентного белка LSSmScarleG, который был разработан на основе предыдущей версии LSSmScarlet2. Основные преимущества LSSmScarlet3 заключаются в более высокой фотостабильности. Это делает его более подходящим для применения в конфокальной микроскопии и визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих. База данных может использоваться для экспансионной микроскопии, визуализации ex. vivo, иммуноокрашивания, флуоресцентной микроскопии, конфокальной визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих и многоцветной конфокальной визуализации в сопряжении с другими флуоресцентными белками. В своей работе могут использовать специалисты в области молекулярной биологии, генетики и биотехнологии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

В базе данных представлены характеристики нового красного флуоресцентного белка LSSmScarlet4, который был разработан на основе предьщущей версии LSSmScarlet3. Основные улучшения LSSmScarlet4 включают значительно более высокую скорость созревания (в 7,6 раз быстрее), повышенную устойчивость к химическим агентам (таким как гуанидин хлорид и гуанидин тиоцианат), и стабильность при различных значениях рН. Это делает его более подходящим для применения в конфокальной микроскопии и визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих. База данных содержит информацию о спектральных свойствах, молекулярной яркости и химической стабильности красного флуоресцентного белка LSSmScarlet4. База данных может использоваться для экспансионной микроскопии, визуализации ex. vivo, иммуноокрашивания, флуоресцентной микроскопии, конфокальной визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих и многоцветной конфокальной визуализации в сопряжении с другими флуоресцентными белками. В своей работе могут использовать специалисты в области молекулярной биологии, генетики и биотехнологии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию об основных спектральных и биохимических свойствах белка, его аминокислотной последовательности, нуклеотидной последовательности кодирующего его гена. Приведены спектры поглощения, возбуждения и излучения, кинетика созревания белка, влияние основных химических факторов на его стабильность и флуоресценцию. Итоговые данные отражают усредненные значения по 3 повторам.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

В Программе моделируется процесс ускорения макротел в мощном электромагнитном рельсовом ускорителе. Уравнения движения макротела в канале ускорителя учитывают нелинейную диффузию магнитного поля, нагрев, абляцию стенок канала и трение. Рассчитываются временные зависимости положения макротела, тока в источнике питания, а также нелинейная диффузия магнитного поля в электроды ускорителя, их импульсный нагрев и абляция. Данная численная модель является полезным инструментом при описании процесса ускорения макротел в электромагнитных ускорителях рельсового типа, а также при трактовке результатов экспериментов. В целом модель позволяет получать адекватное согласование с данными эксперимента и может использоваться для прогнозирования экспериментов по электродинамическому ускорению макротел и оптимизации эффективности преобразования энергии из источника питания в кинетическую энергию движения. Программа имеет интерактивный интерфейс для ввода начальных параметров и граничных условий. Visual Fortran в среде Developer Studio

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации об аминокислотных последовательностях эффекторных нуклеаз систем CRISPR/Cas II и V типов, встречающихся в микробных сообществах микробиоты лошади. БД получена анализом результатов полнометагеномного секвенирования 12 образцов микробиоты лошади (Бурятия). БД включает 16 аминокислотных последовательностей Cas- эффекторных нуклеаз. Также для каждой аминокислотной последовательности представлен предполагаемый тип CRISPR-Cas системы: II или V, и их подтип. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) содержит информацию об аминокислотных последовательностях ферментов, кодируемых генами амидаз, выделенными из бактерий рода Rhodococcus. Каждая запись в БД включает полную аминокислотную последовательность фермента с указанием штамма-источника. Основное назначение БД – поддержка исследовательских проектов, связанных с изучением структурных и функциональных особенностей амидаз, их филогении и биотехнологических применений. С помощью БД исследователи могут проводить сравнительный анализ аминокислотных последовательностей, изучать их эволюционные взаимосвязи, а также выявлять ключевые аминокислотные остатки, которые могут быть мишенями для направленного мутагенеза и оптимизации ферментативной активности. Вид и версия системы управления базой данных: Excel Объем базы данных: 186 КБ

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию об олигонуклеотидных полиморфизмах (SNP), характеризующих разные сорта маслины . На сегодняшний день это единственная генетическая база в России по сортам маслины европейской . Информация из базы данных расширяет научные знания о генетике и филогении маслины европейской . Созданная база будет полезна и интересна для специалистов, изучающих данную плодовую культуру.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о цветении водоемов на территории Российской Федерации с начала XX века и до 2021 года. Всего описано 208 вспышек цветения естественных и искусственных пресноводных водоемов, морей и океанов. Для каждого случая указаны год, географические координаты широты и долготы места возникновения вспышки цветения, субъект Российской Федерации, в котором произошла вспышка, а также название водоема. При наличии, указано описание массового развития фотосинтезирующих микроорганизмов из СМИ, ссылка на страницу в сети Интернет с информацией о вспышке. При наличии, в базе данных представлены ссылки на научные публикации с развернутой информацией об исследованиях, проводимых после возникновения приведенных в базе вспышек цветения. База данных представляет интерес для экологов, микробиологов, альгологов и биотехнологов. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)