Базы данных

База данных предназначена для сбора, хранения и сравнительного анализа геномных сигнатур перспективных штаммов винодельческих дрожжей. БД представляет собой набор целых чисел, однозначно соответствующих коротким фрагментам ДНК длиной 31 нуклеотид, идентифицирующим генетическую информацию данного дрожжей. БД получена анализом полных геномных сборок 19 штаммов перспективных винодельческих дрожжей, исследованных сотрудниками Курчатовского геномного центра. БД позволяет проводить экспресс-идентификацию образцов винодельческих дрожжей на основании данных секвенирования или геномных сборок.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию об основных спектральных и биохимических свойствах белка, его аминокислотной последовательности, нуклеотидной последовательности кодирующего его гена. Приведены спектры поглощения, возбуждения и излучения, кинетика созревания белка, влияние основных химических факторов на его стабильность и флуоресценцию. Итоговые данные отражают усредненные значения по 3 повторам.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

В базе данных представлены характеристики нового красного флуоресцентного белка LSSmScarlet4, который был разработан на основе предьщущей версии LSSmScarlet3. Основные улучшения LSSmScarlet4 включают значительно более высокую скорость созревания (в 7,6 раз быстрее), повышенную устойчивость к химическим агентам (таким как гуанидин хлорид и гуанидин тиоцианат), и стабильность при различных значениях рН. Это делает его более подходящим для применения в конфокальной микроскопии и визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих. База данных содержит информацию о спектральных свойствах, молекулярной яркости и химической стабильности красного флуоресцентного белка LSSmScarlet4. База данных может использоваться для экспансионной микроскопии, визуализации ex. vivo, иммуноокрашивания, флуоресцентной микроскопии, конфокальной визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих и многоцветной конфокальной визуализации в сопряжении с другими флуоресцентными белками. В своей работе могут использовать специалисты в области молекулярной биологии, генетики и биотехнологии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию об определении оптимумов и пределов толерантности по содержанию магния для штамма цианобактерии Synechocystis sp. GFP, содержащего в себе ген флуоресцентного белка. Описаны эксперименты по влиянию на рост и развитие микроорганизма содержания в среде магния. Оценка проводилась на основании результатов измерения оптической плотности спиртового экстракта клеток. База данных представляет интерес для микробиологов, экологов и биотехнологов.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию о нуклеотидной и аминокислотной последовательности, интенсивности красной флуоресценции, молекулярной яркости и химической стабильности и некоторых других свойствах красного флуоресцентного белка LSSmScarleG, который был разработан на основе предыдущей версии LSSmScarlet2. Основные преимущества LSSmScarlet3 заключаются в более высокой фотостабильности. Это делает его более подходящим для применения в конфокальной микроскопии и визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих. База данных может использоваться для экспансионной микроскопии, визуализации ex. vivo, иммуноокрашивания, флуоресцентной микроскопии, конфокальной визуализации структурных белков в живых клетках млекопитающих и многоцветной конфокальной визуализации в сопряжении с другими флуоресцентными белками. В своей работе могут использовать специалисты в области молекулярной биологии, генетики и биотехнологии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию об определении оптимумов и пределов толерантности по содержанию фосфора для штамма цианобактерии Synechocystis sp. GFP, содержащего в себе ген флуоресцентного белка. Описаны эксперименты по влиянию на рост и развитие микроорганизма содержания в среде фосфора. Оценка проводилась на основании результатов измерения оптической плотности спиртового экстракта клеток. База данных представляет интерес для микробиологов, экологов и биотехнологов.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных предназначена для сбора, хранения и анализа информации о последовательностях направляющих РНК для CRJSPR-опосредованного редактирования гена ADE2 в геноме Komagataella kurtzmanii с использованием систем CRISPR-Cas типов II и V. База данных была создана на основе анализа генома Komagataella kurtzmanii с использованием специализированного программного обеспечения для поиска направляющих РНК, минимизирующих нецелевые эффекты. База данных включает 107 последовательностей направляющих РНК систем CRISPR-Cas типов II и V. Направляющие РНК нацелены на ДНК-мишени с различными последовательностями РАМ, что позволяет адаптировать их под использование в комплексе с эффекторными белками с различной РАМ-специфичностью. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и клеточной биологии, а также биоинженерии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных предназначена для упорядоченного хранения результатов корреляционного анализа математических моделей анатомического строения головного мозга, построенных по результатам обработки и анализа экспериментальных МРТ-данных головного мозга человека, выполненных в различных режимах MP томографа для одного испытуемого.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит результаты функциональной аннотации 1023 геномов типовых штаммов аскомицетных грибов. Для каждого белка приведена следующая информация: геномная сборка, порядковый номер гена, функциональная категория кластера ортологичных генов, описание гена, предпочтительное наименование, номер Enzyme Comission, онтология по базе KEGG КО.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) содержит актуальную на июнь 2024 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях и патентах) зарубежных и российских исследователей, в которых описаны дрожжевые Штаммы микроорганизмов-продуценты L- и D-молочной кислоты, источники генов гетерологичных лактатдегидрогеназ, экспрессируемых в клетках дрожжей, подходы метаболической инженерии для создания продуцентов, способы культивирования штаммов-продуцентов. БД создана для использования при конструировании продуцентов молочной кислоты мирового уровня на основе дрожжей, а также для выбора необходимых генетических элементов и модификаций для редактирования дрожжевого генома. Из источников, в которых описаны работы по созданию штаммов-продуцентов молочной кислоты, были выбраны источники, содержащие информацию только по дрожжевым продуцентам молочной кислоты. БД могут использовать в своей работе специалисты в области генетической инженерии дрожжей, биотехнологи и микробиологи.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)