Базы данных

База данных содержит результаты функциональной аннотации 1023 геномов типовых штаммов аскомицетных грибов. Для каждого белка приведена следующая информация: геномная сборка, порядковый номер гена, функциональная категория кластера ортологичных генов, описание гена, предпочтительное наименование, номер Enzyme Comission, онтология по базе KEGG КО.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) содержит актуальную на июнь 2024 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях и патентах) зарубежных и российских исследователей, в которых описаны дрожжевые Штаммы микроорганизмов-продуценты L- и D-молочной кислоты, источники генов гетерологичных лактатдегидрогеназ, экспрессируемых в клетках дрожжей, подходы метаболической инженерии для создания продуцентов, способы культивирования штаммов-продуцентов. БД создана для использования при конструировании продуцентов молочной кислоты мирового уровня на основе дрожжей, а также для выбора необходимых генетических элементов и модификаций для редактирования дрожжевого генома. Из источников, в которых описаны работы по созданию штаммов-продуцентов молочной кислоты, были выбраны источники, содержащие информацию только по дрожжевым продуцентам молочной кислоты. БД могут использовать в своей работе специалисты в области генетической инженерии дрожжей, биотехнологи и микробиологи.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о названии белка, аминокислотной последовательности, а также молекулярной массе пептидов, полученных в результате гидролиза трипсином, в диапазоне от 50 до 2000 Да. БД получена путем анализа аминокислотных последовательностей 61 выделяемого белка и теоретического расчета молекулярных масс пептидов, образующихся в результате гидролиза этих белков трипсином. БД создана для идентификации и подтверждения аминокислотной последовательности белков, отсутствующих в открытых базах данных UniProt и Swiss-Prot, методом пептидной дактилоскопии. БД представляет интерес для биохимиков и специалистов в области белковой хроматографии, может быть использована для подтверждения аминокислотной последовательности (подлинности) целевого белка, в том числе на стадии продукции, а также оценки качества белкового препарата.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о последовательностях направляющих РНК системы редактирования генома CRISPR-Cas V типа, с помощью которых можно вносить направленные делеций в геном клеточной линии НЕК293Т в трех генах: DNMT1, ЕМХ1 и VEGFA. БД получена путем анализа целевых участков генома клеточной линии НЕК293Т и поиска направляющих РНК с наименьшим офф-таргет эффектом с использованием разработанного биоинформатического пайплайна. База данных включает 44 последовательности направляющих РНК системы CRISPR-Cas V типа. Направляющие РНК нацелены на ДНК- мишени с различными последовательностями РАМ, что позволяет адаптировать их под использование в комплексе с эффекторными белками с различной РАМ-специфичностью. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и клеточной биологии, а также биоинженерии. FASTA, текстовая таблица.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации об аминокислотных последовательностях эффекторных нуклеаз систем CRISPR/Cas II и V типов, встречающихся в микробных сообществах микробиоты лошади. БД получена анализом результатов полнометагеномного секвенирования 12 образцов микробиоты лошади (Бурятия). БД включает 16 аминокислотных последовательностей Cas- эффекторных нуклеаз. Также для каждой аминокислотной последовательности представлен предполагаемый тип CRISPR-Cas системы: II или V, и их подтип. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о нуклеотидных последовательностях спейсеров, которые могут использоваться для создания направляющих РНК для Cas-эффекторов системы CRISPR-Cas VI типа, направленных против РНК карантинных фитопатогенных вирусов. БД получена анализом результатов всех представленных в базе данных NCBI virus последовательностях (дата обращения 03.07.2024) следующих вирусов растений: бенивирус некротического пожелтения жилок свеклы (Beet necrotic yellow vein virus), вирус некротической пятнистости бальзамина (Impatiens necrotic spot virus), вирус пятнистого увядания томата (Tomato spotted wilt virus), неповирус кольцевой пятнистости табака (Tobacco ringspot virus), вироид веретеновидности клубней картофеля (Potato spindle tuber viroid). БД включает ранжированный список спейсеров, нацеленных на высоко консервативные участки РНК фитопатогенов вирусной природы, созданный с использованием веб-ресурса https://casl3design.nygenome.org/. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной биологии, биотехнологии, а также биоинженерии и использоваться для создания диагностических систем обнаружения карантинных фитопатогенов, основанных на системе CRISPR-Cas.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных представляет собой структурированную подборку ключевых научных статей, в которых описаны современные исследования по созданию живых генномодифицированных бактериальных вакцин. База данных содержит актуальные публикации по данному направлению в реферируемых международных журналах за период с 1987 по 2025 гг., а также подборку ссылок на данные статьи, размещенных в сети Интернет в свободном доступе. База данных содержит электронный каталог в форме Excel, информация в котором структурирована по нескольким параметрам: авторы, название статьи, год выхода статьи, название журнала и выходные данные, цифровой идентификатор объекта doi, идентификатор публикации в базе данных PubMed, организм, на базе которого предлагается вакцинный штамм, ген для его модификации, патоген, против которого направлена живая бактериальная вакцина, а также аннотация статьи. Включены современные исследования, охватывающие методы конструирования, эффективность и безопасность таких вакцин. База данных предназначена для ученых, преподавателей, аспирантов и студентов, занимающихся преподаванием и ведущих научные исследования в области вакцинологии и инфекционных заболеваний, иммунологии, микробиологии и биотехнологии, а также сотрудников научно-исследовательских отделов предприятий биотехнологической, фармакологической отраслей промышленности, связанных с разработкой вакцин.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит сведения об объёмах парных анатомических структур левого и правого полушарий головного мозга человека, а также значения межполушарных коэффициентов пропорциональности (соотношение данных объёмов) головного мозга испытуемого, вычисленных по результатам обработки и анализа экспериментальных МРТ-данных.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит изображения, которые демонстрируются испытуемым людям или обрабатываются компьютерными программами в процессе прохождения заданий Теста на интеллектуальность. Базу данных применяют при организации соревнований компьютерных программ, которые предназначаются для распознавания. Базу данных используют также при измерении Коэффициента Интеллекта (IQ) людей. База данных может служить для тренировки систем машинного обучения, например, глубоких нейронных сетей в целях возможной демонстрации способностей искусственного интеллекта по зрительному восприятию с качеством, близким к человеческому.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных содержит информацию о сообщениях о цветении водоемов на территории Российской Федерации в 2016-2018 годах. Представлен анализ сообщений в СМИ о возникновении массового развития фототрофных организмов. База данных представляет интерес для микробиологов и экологов.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)