Базы данных

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о нуклеотидных последовательностях спейсеров, которые могут использоваться для создания направляющих РНК для Cas-эффекторов системы CRISPR-Cas VI типа, направленных против РНК карантинных фитопатогенных вирусов. БД получена анализом результатов всех представленных в базе данных NCBI virus последовательностях (дата обращения 03.07.2024) следующих вирусов растений: бенивирус некротического пожелтения жилок свеклы (Beet necrotic yellow vein virus), вирус некротической пятнистости бальзамина (Impatiens necrotic spot virus), вирус пятнистого увядания томата (Tomato spotted wilt virus), неповирус кольцевой пятнистости табака (Tobacco ringspot virus), вироид веретеновидности клубней картофеля (Potato spindle tuber viroid). БД включает ранжированный список спейсеров, нацеленных на высоко консервативные участки РНК фитопатогенов вирусной природы, созданный с использованием веб-ресурса https://casl3design.nygenome.org/. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной биологии, биотехнологии, а также биоинженерии и использоваться для создания диагностических систем обнаружения карантинных фитопатогенов, основанных на системе CRISPR-Cas.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о названии белка, аминокислотной последовательности, а также молекулярной массе пептидов, полученных в результате гидролиза трипсином, в диапазоне от 50 до 2000 Да. БД получена путем анализа аминокислотных последовательностей 61 выделяемого белка и теоретического расчета молекулярных масс пептидов, образующихся в результате гидролиза этих белков трипсином. БД создана для идентификации и подтверждения аминокислотной последовательности белков, отсутствующих в открытых базах данных UniProt и Swiss-Prot, методом пептидной дактилоскопии. БД представляет интерес для биохимиков и специалистов в области белковой хроматографии, может быть использована для подтверждения аминокислотной последовательности (подлинности) целевого белка, в том числе на стадии продукции, а также оценки качества белкового препарата.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа генетических вариаций штаммов бактериальных молочных заквасок, относящихся к виду Lactococcus cremoris. База данных получена анализом результатов высокопроизводительного секвенирования 13 коллекционньгх бактериальных штаммов, депонированных во Всероссийской коллекции Промышленных Микроорганизмов. БД суммарно включает вариации в 28 905 локусах, аннотированных относительно полного референсного генома штамма Lactococcus cremoris MG1363. В БД приведены однонулкотидные замены, инсерции и делеции. БД представляет интерес для специалистов с области геномики, эволюционной биологии, промышленных биотехнологий, пищевых технологий и биомедицины. BCFtools версия 1.7 и новее, Microsoft Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)