Базы данных

База данных (БД) содержит актуализированную на июль 2023 года информацию о публично доступных источниках (научных статьях) зарубежных и российских исследователей, посвященных продукции у С. glutamicum аминокислоты L валин и родственных соединений. В представленных источниках приводятся: биохимические реакции пути биосинтеза L валина; ферменты, их катализирующие, и гены этих ферментов; транспортные системы, участвующие в переносе L валина наружу и внутрь клетки, механизмы регуляции биосинтеза и транспорта L- валина; подходы к увеличению продукции данной аминокислоты. Ценность БД заключатся в том, что из большого массива источников, в которых описаны метаболические процессы С. glutamicum и участвующие в них гены, ферменты и регуляторные факторы, автор с использованием накопленного опыта вручную (поскольку такая работа не может быть автоматизирована) выбрал работы, содержащие данные по продукции L-валина и его предшественников. БД предназначена для использования специалистами в области создания на основе С. glutamicum продуцентов L-валина и родственных соединений, а также учёными, занимающимися изучением генетики, биохимии и физиологии коринебактерий. Microsoft Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для хранения и обработки данных по биокинетике наночастиц серебра и золота в организме лабораторных животных. База данных содержит структурированную информацию по результатам оценки распределения наночастиц золота и серебра в организме лабораторных животных, полученную экспериментальным путем. Схема базы данных отображает связи следующих таблиц: сведения о лабораторном животном, характеристика суспензии наночастиц, вид наночастиц, способ введения суспензии наночастиц в организм лабораторных животных, характеристика распределения (массовой доли) наночастиц в органах лабораторных животных, ссылка на дату проведения эксперимента или на публикацию (если данные опубликованы). База данных может быть использована в научных исследованиях. Тип реализующей ЭВМ: IBM PC - совмест. ПК Вид и версия системы управления базой данных: Office Access 2013 Вид и версия операционной системы: Windows 7

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Государственный научный центр Российской Федерации - Федеральный медицинский биофизический центр имени А.И. Бурназяна» (ФГБУ ГНЦ ФМБЦ им. А.И. Бурназяна ФМБА России) (RU)

База данных (БД) содержит информацию о полных геномах типовых штаммов Актинобактерий. В базе данных представлены 91378 значений средней аминокислотной идентичности (САИ) наборов кодирующих последовательностей, стандартного отклонения САИ и доле от набора генов, определённых на основании алгоритма выравнивания diamond. В базе данных представлены 19030 значений средней нуклеотидной идентичности (СНИ) геномных последовательностей и доли длины выравнивания, рассчитанные алгоритмом fastANI. Для каждого генома указан идентификатор в базе данных NCBI RefSeq, таксономический идентификатор в базе NCBI Taxonomy, таксономическое наименование и статус репрезентативного генома (1 - да, 0 - нет) на основании СНИ. БД представляет интерес для биоинформатиков, молекулярных биологов и специалистов в области биотехнологий для верификации таксономии и оптимизации биотехнологических работ, включая конструирование новых штаммов. БД создана в рамках соглашения с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации от 31.10.2020 № 075-5-2019-1659. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит полный набор нейтронно-физических данных, составленный на основе файлов оцененных ядерных данных ENDF/B-VI.8, необходимый для решения задач по определению изотопной композиции материалов при облучении в потоке нейтронов в ядерном реакторе и последующей выдержке. На основе библиотечных данных возможно составить векторы тяжелых нуклидов и продуктов деления полные в том смысле, что нейтронные реакции и естественный распад не выводят их дочерние изотопы за пределы указанных векторов с учетом следующих дополнительных ограничений. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows. dBase III/IV

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит данные, необходимые для моделирования материальных и экономических характеристик ядерных энергетических систем (ЯЭС) в программе STEM-NES. Разрабатывалась для действующих и перспективных энергетических реакторных установок, используемых и перспективных типов ядерного топлива. Включает в себя: номенклатуру типов реакторов, номенклатуру и характеристики ТВС, номенклатуру идентификаторов, эксплуатационных характеристик перспективных реакторных установок и другое. База данных предназначена для: описания жизненного цикла энергетических реакторных установок в ЯЭС, моделирования изотопного состава отработавшего ядерного топлива с момента выгрузки из реактора и последующего хранения до переработки, расчёта технических и экономических характеристик ЯЭС в динамике. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК. ОС: Windows. Access

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о генах путей синтеза трегалозы у фототрофных Альфа- и Бета-протеобактерий. При наличии, указаны аминокислотные последовательности, гомологичные последовательностям белков, кодируемых этими генами. База данных представляет интерес для микробиологов и биотехнологов. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию о термодинамических свойствах примерно 2000 веществ в конденсированном и газообразном состоянии. Численные данные о термодинамических свойствах веществ могут охватывать широкий интервал температур - до 6000 К для конденсированного состояния и до 10000 К для газов. В базу данных внесены свойства оксидов, карбидов, нитридов, теллуридов, фторидов, силицидов различных продуктов деления, актинидов и других компонентов, которые выбирались на основе анализа известных литературных источников и других аналогичных баз данных. База данных может пополняться свойствами других компонентов при необходимости. Полный набор параметров для каждого индивидуального вещества в БД включает: химическую формулу вещества с целочисленными стехиометрическими коэффициентами и с указанием фазового (агрегатного) состояния вещества и величины заряда (для ионов); температурные пределы аппроксимации (Tmin, Tmax); коэффициенты полинома, аппроксимирующего приведённую энергию Гиббса (температурная зависимость); стандартную теплоту образования вещества минус стандартное изменение энтальпии. База данных предназначена для константного обеспечения термодинамических расчётов различных видов облучённого ядерного топлива в микротвэлах реакторов типа ВТГР и ВТРС. Вид и версия системы управления базой данных: Notepad++ Объем базы данных: 0,8 МБ

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о системах CRISPR/Cas, встречающихся в микробных сообществах микробиоты глубоководных рыб. БД получена анализом результатов полнометагеномного секвенирования микробиоты глубоководных рыб. База данных включает 113 CRISPR/Cas-оперонов. Для каждого оперона приведены его основные характеристики и нуклеотидные последовательности. Также для каждого CRISPR/Cas-оперона представлен предполагаемый тип CRISPR-Cas-системы. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для сбора, хранения и анализа информации об обнаруженных в геномах коллекционных штаммов актинобактерий (актиномицет) биосинтетеических кластерах и их компонентах. База данных получена анализом геномов 23 бактерий, принадлежащих к следующим родам актинобактерий: Rhodococcus, Kocuria, Bifidobacterium, Dietzia, Arthrobacter и Cellulomonas. База данных включает 8175 аннотированных белок-кодирующих последовательностей, расположенных в 477 локусах. Для каждого предсказанного кластера приведены аминокислотные последовательности белок-кодирующих генов, структурные и функциональные аннотации и нуклеотидные последовательности кластеров. База данных может представлять интерес для специалистов с области молекулярной и эволюционной биологии, промышленных биотехнологий и биомедицины. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит результаты автоматической сегментации анатомических структур головного мозга человека, с указанием названий и объёмов мозговых структур, полученные вследствие обработки и математического анализа экспериментальных данных ядерной магнитно-резонансной томографии (МРТ) головного мозга человека. Данная информация используется для построения 3D-модели головного мозга и нейровизуализации с целью научно-исследовательского анализа или в медицинских целях (ранняя диагностика патологии, отслеживание динамики изменений мозговых структур и другое). Тип ЭВМ: Рабочая станция Apple Mac Mini на базе архитектуры х86; ОС: Linux, Windows, MacOS. -

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)