Базы данных

В базе данных описаны виды стресса у молочнокислых бактерий, физиологические проявления и молекулярно-генетические механизмы устойчивости молочнокислых бактерий к различным видам стресса. База предназначена для ученых, преподавателей, аспирантов и студентов, занимающихся преподаванием и ведущих научные исследования в области генетики, микробиологии и биотехнологии молочнокислых бактерий, а также сотрудников научно- исследовательских отделов предприятий пищевой, кормовой, биотехнологической, фармакологической отраслей промышленности, связанных с разработкой продуктов на основе молочнокислых бактерий. Язык БД: Visual Basic. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию об определении оптимумов и пределов толерантности по содержанию фосфора для цианобактерии Aliinostoc sp., выделенной из озера Байкал. Описаны эксперименты по влиянию на рост и развитие микроорганизма содержания в питательной среде фосфора. Оценка проводилась на основании результатов измерения оптической плотности спиртового экстракта клеток. База данных представляет интерес для микробиологов, экологов и биотехнологов.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных представляет собой наборы данных для однокопийных консервативных маркерных генов: марковская модель для поиска маркерных последовательностей в данных секвенирования, филогенетического древа для классификации прочтений и таксономии терминальных узлов филогенетического древа. Для создания базы данных была проведена фильтрация идентичных последовательностей маркерных генов из исходного набора (более 57 тыс. последовательностей) базы GTDB (База данных полногеномной таксономии), множественное выравнивание отфильтрованных последовательностей, формирование марковской модели, построение филогенетического древа и тестирование полученного набора. GraftM

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа частот использования кодонов в геномах типовых штаммов грибов. Ввиду избыточности генетического кода одна аминокислота может быть кодирована более чем одним триплетом нуклеотидов (кодонов). При этом синонимичные замены не влияют на структуру и функции белка, а замена минорных (редких) кодонов на синонимичные мажорные (частые) приводит к увеличению скорости синтеза пептидов. Таким образом, знание частот использования кодонов может помочь в выборе оптимальных кодонов для повышения эффективности трансляции гена для целей биотехнологии. Для 1 043 публично доступных геномов типовых штаммов грибов были предсказаны открытые рамки считывания и определены относительные частоты для каждого из 64 кодонов. Каждая запись сопровождается бинарной таксономией и таксономическим идентификатором NCBI для упрощения дальнейшей работы с базой. БД может представлять интерес для биоинженеров, молекулярных биологов, биотехнологов и биоинформатиков. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о системах CRISPR/Cas, встречающихся в микробных сообществах микробиоты глубоководных рыб. БД получена анализом результатов полнометагеномного секвенирования микробиоты глубоководных рыб. База данных включает 113 CRISPR/Cas-оперонов. Для каждого оперона приведены его основные характеристики и нуклеотидные последовательности. Также для каждого CRISPR/Cas-оперона представлен предполагаемый тип CRISPR-Cas-системы. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и эволюционной биологии, а также биоинженерии. Excel

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию об олигонуклеотидных полиморфизмах (SNP), характеризующих разные сорта маслины . На сегодняшний день это единственная генетическая база в России по сортам маслины европейской . Информация из базы данных расширяет научные знания о генетике и филогении маслины европейской . Созданная база будет полезна и интересна для специалистов, изучающих данную плодовую культуру.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит информацию об олигонуклеотидных полиморфизмах (SNP), характеризующих разные сорта данной плодовой культуры. На сегодняшний день это единственная генетическая база в России по сортам персика обыкновенного, уникальная коллекция которого собрана в Никитском ботаническом саду. Информация из базы данных расширяет научные знания о генетике и филогении персика. База данных будет полезна и интересна для специалистов изучающих данную плодовую культуру. MongoDB 4.4.3

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных содержит таблицы с заселенностями и энергиями молекулярных орбиталей кластеров AnO8 (An = Th - Lr) в диапазоне энергий МО от ~ -10 до ~50 эВ, рассчитанные релятивистским методом дискретного варьирования (РДВ), а также сечения фотоэффекта An 6s-, 6p1/2-, 6р3/2-, 6b3/2-, 6d5/2-, 7S-, 5f5/2-, 5f7/2-, 7р1/2-, 7р3/2- и O 2s-, 2p1/2-, 2р3/2-электронов. Эти таблицы необходимы для расшифровки рентгеновских спектров (фотоэлектронных, конверсионных, эмиссионных, поглощения, резонансной эмиссии валентных электронов и др.) База данных представляет интерес для специалистов в области рентгеноэлектронной спектроскопии.

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (RU)

База данных предназначена для валидации программ для ЭВМ, применяемых для обоснования безопасной эксплуатации реакторов РБМК, в том числе для анализа тяжелых стадий запроектных аварий. База данных состоит из данных по моделированию на критстенде РБМК тяжелой стадии запроектных аварий, а также данных, полученных из экспериментов на критсборках по измерению реактивности систем, пространственного распределения потока нейтронов, взвешиванию отдельных элементов сборок, определению эффектов обезвоживания.

Акционерное общество «Российский концерн по производству электрической и тепловой энергии на атомных станциях» (RU) Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «КУРЧАТОВСКИЙ ИНСТИТУТ» (RU)

База данных (БД) предназначена для сбора, хранения и анализа информации о последовательностях направляющих РНК системы редактирования генома CRISPR-Cas V типа, с помощью которых можно вносить направленные делеций в геном клеточной линии НЕК293Т в трех генах: DNMT1, ЕМХ1 и VEGFA. БД получена путем анализа целевых участков генома клеточной линии НЕК293Т и поиска направляющих РНК с наименьшим офф-таргет эффектом с использованием разработанного биоинформатического пайплайна. База данных включает 44 последовательности направляющих РНК системы CRISPR-Cas V типа. Направляющие РНК нацелены на ДНК- мишени с различными последовательностями РАМ, что позволяет адаптировать их под использование в комплексе с эффекторными белками с различной РАМ-специфичностью. БД может представлять интерес для специалистов в области молекулярной и клеточной биологии, а также биоинженерии. FASTA, текстовая таблица.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (RU)